Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGN3Q15651 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGN3Q15651 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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