Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR1Q15399 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR1Q15399 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms