Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC41Q15345 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC41Q15345 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC41Q15345 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms