Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GINS1Q14691 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GINS1Q14691 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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