Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PDE3BQ13370 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PDE3BQ13370 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
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