Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 NAA60-232ENST00000575936 547 ntTSL 47.05□□□□□ -1.289e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 NAA60-226ENST00000574762 537 ntTSL 27.05□□□□□ -1.289e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 NAA60-213ENST00000572169 582 ntTSL 27.05□□□□□ -1.289e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 PHB-209ENST00000508009 451 ntTSL 57.02□□□□□ -1.299e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 IGF2BP2-209ENST00000493302 358 ntTSL 57.01□□□□□ -1.292e-12■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 MEST-203ENST00000378576 2180 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.299e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 NGDN-207ENST00000556103 454 ntTSL 36.88□□□□□ -1.319e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 RPL35A-208ENST00000485439 677 ntTSL 26.73□□□□□ -1.339e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 NAA60-223ENST00000574256 266 ntTSL 36.73□□□□□ -1.339e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 MEST-215ENST00000463263 764 ntTSL 56.71□□□□□ -1.349e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC6.69□□□□□ -1.349e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 RPL35A-203ENST00000439255 564 ntTSL 56.61□□□□□ -1.359e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 NAA60-216ENST00000572757 818 ntTSL 26.56□□□□□ -1.369e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 MSRB1-203ENST00000473663 373 ntTSL 56.42□□□□□ -1.389e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 METAP1D-202ENST00000392582 460 ntTSL 56.4□□□□□ -1.389e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 RPL35A-209ENST00000496582 579 ntTSL 26.34□□□□□ -1.399e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 ABCC10-210ENST00000505344 721 ntTSL 36.19□□□□□ -1.429e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 COPS6-209ENST00000483891 734 ntTSL 35.78□□□□□ -1.489e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 RPL35A-202ENST00000429437 442 ntTSL 55.6□□□□□ -1.519e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 KCTD2-203ENST00000577516 616 ntTSL 45.56□□□□□ -1.529e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 CTDSP2-208ENST00000552294 436 ntTSL 55.44□□□□□ -1.549e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 PRR7-AS1-202ENST00000506465 421 ntTSL 35.38□□□□□ -1.559e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 MBTD1-206ENST00000591270 2163 ntTSL 25.32□□□□□ -1.569e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 WDR59-215ENST00000568462 550 ntTSL 44.96□□□□□ -1.629e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 RPL35A-201ENST00000329092 456 ntTSL 34.51□□□□□ -1.699e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 RPL35A-204ENST00000442341 517 ntTSL 34.31□□□□□ -1.729e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.779e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 CDC6-205ENST00000582402 353 ntTSL 33.8□□□□□ -1.89e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.819e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 SFXN5-216ENST00000484123 351 ntTSL 23.41□□□□□ -1.869e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 NAA60-228ENST00000575042 328 ntTSL 33.31□□□□□ -1.889e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 MSL1-211ENST00000583127 572 ntTSL 43.16□□□□□ -1.99e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 CFAP43-205ENST00000434629 3198 ntTSL 1 (best)2.88□□□□□ -1.959e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.59□□□□□ -2.159e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.619e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 CAMTA2-212ENST00000574951 4431 ntTSL 512.89□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 CAMTA2-211ENST00000574606 534 ntTSL 510.46□□□□□ -0.731e-6■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 WDR90-212ENST00000548844 472 ntTSL 312.98□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 44.4
SF3A3Q12874 CPT1B-203ENST00000395650 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 44.4
SF3A3Q12874 CPT1B-204ENST00000405237 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 44.4
SF3A3Q12874 CHKB-CPT1B-202ENST00000453634 2816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.482e-7■■■■■ 44.4
SF3A3Q12874 CPT1B-201ENST00000312108 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.82e-7■■■■■ 44.4
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SF3A3Q12874 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.667e-7■■■■■ 44.3
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SF3A3Q12874 KLC2-209ENST00000461611 643 ntTSL 315.04■□□□□ -07e-7■■■■■ 44.3
SF3A3Q12874 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.167e-7■■■■■ 44.3
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SF3A3Q12874 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.26e-7■■■■■ 44.3
SF3A3Q12874 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.276e-7■■■■■ 44.3
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SF3A3Q12874 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.426e-7■■■■■ 44.3
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SF3A3Q12874 PFKFB4-212ENST00000478516 579 ntTSL 38.61□□□□□ -1.033e-8■■■■■ 44.1
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SF3A3Q12874 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.751e-8■■■■■ 44
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SF3A3Q12874 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 44
SF3A3Q12874 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 44
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SF3A3Q12874 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.186e-7■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 UBE2J2-207ENST00000435198 1056 ntTSL 322.35■■□□□ 1.176e-7■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.096e-7■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 UBE2J2-210ENST00000464036 1256 ntTSL 321.13■□□□□ 0.976e-7■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.916e-7■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 UBE2J2-214ENST00000473215 1028 ntTSL 319.72■□□□□ 0.756e-7■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 GNB3-209ENST00000542868 616 ntTSL 1 (best)18.4■□□□□ 0.546e-7■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 TBRG1-205ENST00000473629 1634 ntTSL 517.87■□□□□ 0.456e-7■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 UBE2J2-220ENST00000509720 472 ntTSL 317.58■□□□□ 0.46e-7■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 TBRG1-207ENST00000529543 2142 ntTSL 1 (best)17.46■□□□□ 0.396e-7■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 GNB3-205ENST00000540458 2869 ntTSL 217.25■□□□□ 0.356e-7■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.326e-7■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.216e-7■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 TBRG1-208ENST00000530731 1571 ntTSL 1 (best)16.28■□□□□ 0.26e-7■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 GNB3-207ENST00000541978 962 ntTSL 213.68□□□□□ -0.226e-7■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.236e-7■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 GNB3-206ENST00000541257 761 ntTSL 513.34□□□□□ -0.276e-7■■■■■ 43.7
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SF3A3Q12874 TBRG1-201ENST00000284290 4468 ntTSL 1 (best)12.33□□□□□ -0.446e-7■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 TBRG1-203ENST00000441174 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.586e-7■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 GNB3-204ENST00000539127 590 ntTSL 311.04□□□□□ -0.646e-7■■■■■ 43.7
SF3A3Q12874 TBRG1-202ENST00000438907 842 ntTSL 1 (best)10.43□□□□□ -0.746e-7■■■■■ 43.7
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