Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
BPTFQ12830 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BPTFQ12830 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BPTFQ12830 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
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