Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
ERCC6Q03468 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
ERCC6Q03468 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
ERCC6Q03468 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
ERCC6Q03468 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC40.34■■■■■ 4.05
ERCC6Q03468 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
ERCC6Q03468 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
ERCC6Q03468 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
ERCC6Q03468 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC40.33■■■■■ 4.05
ERCC6Q03468 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
ERCC6Q03468 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
ERCC6Q03468 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
ERCC6Q03468 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC40.28■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
ERCC6Q03468 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC40.24■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC40.23■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC40.19■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.03
ERCC6Q03468 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
ERCC6Q03468 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms