Protein–RNA interactions for Protein: Q02543

RPL18A, 60S ribosomal protein L18a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18AQ02543 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL18AQ02543 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL18AQ02543 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms