Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SP4Q02446 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SP4Q02446 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SP4Q02446 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SP4Q02446 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SP4Q02446 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SP4Q02446 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SP4Q02446 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SP4Q02446 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SP4Q02446 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SP4Q02446 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SP4Q02446 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SP4Q02446 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SP4Q02446 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SP4Q02446 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SP4Q02446 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SP4Q02446 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SP4Q02446 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SP4Q02446 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SP4Q02446 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SP4Q02446 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SP4Q02446 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SP4Q02446 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SP4Q02446 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SP4Q02446 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SP4Q02446 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SP4Q02446 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SP4Q02446 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SP4Q02446 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP4Q02446 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP4Q02446 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP4Q02446 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP4Q02446 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP4Q02446 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP4Q02446 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP4Q02446 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP4Q02446 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP4Q02446 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP4Q02446 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP4Q02446 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP4Q02446 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SP4Q02446 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP4Q02446 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP4Q02446 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP4Q02446 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP4Q02446 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP4Q02446 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP4Q02446 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP4Q02446 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SP4Q02446 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP4Q02446 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP4Q02446 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP4Q02446 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP4Q02446 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SP4Q02446 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP4Q02446 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP4Q02446 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP4Q02446 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SP4Q02446 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP4Q02446 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP4Q02446 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP4Q02446 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP4Q02446 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP4Q02446 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP4Q02446 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP4Q02446 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SP4Q02446 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP4Q02446 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP4Q02446 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SP4Q02446 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SP4Q02446 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SP4Q02446 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SP4Q02446 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SP4Q02446 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SP4Q02446 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SP4Q02446 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SP4Q02446 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SP4Q02446 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SP4Q02446 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP4Q02446 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP4Q02446 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP4Q02446 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP4Q02446 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP4Q02446 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP4Q02446 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP4Q02446 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP4Q02446 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SP4Q02446 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP4Q02446 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP4Q02446 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP4Q02446 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP4Q02446 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SP4Q02446 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SP4Q02446 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SP4Q02446 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SP4Q02446 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SP4Q02446 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SP4Q02446 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SP4Q02446 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SP4Q02446 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms