Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MC1RQ01726 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms