Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VLDLRP98155 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VLDLRP98155 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VLDLRP98155 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
VLDLRP98155 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VLDLRP98155 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VLDLRP98155 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VLDLRP98155 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VLDLRP98155 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VLDLRP98155 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VLDLRP98155 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VLDLRP98155 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VLDLRP98155 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VLDLRP98155 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VLDLRP98155 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms