Protein–RNA interactions for Protein: P85037

FOXK1, Forkhead box protein K1, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXK1P85037 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXK1P85037 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXK1P85037 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXK1P85037 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXK1P85037 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXK1P85037 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXK1P85037 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXK1P85037 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXK1P85037 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXK1P85037 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXK1P85037 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXK1P85037 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXK1P85037 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXK1P85037 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXK1P85037 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXK1P85037 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXK1P85037 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXK1P85037 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXK1P85037 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXK1P85037 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FOXK1P85037 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FOXK1P85037 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXK1P85037 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXK1P85037 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXK1P85037 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FOXK1P85037 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXK1P85037 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FOXK1P85037 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXK1P85037 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXK1P85037 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXK1P85037 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXK1P85037 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXK1P85037 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXK1P85037 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXK1P85037 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXK1P85037 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXK1P85037 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXK1P85037 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXK1P85037 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXK1P85037 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXK1P85037 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXK1P85037 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXK1P85037 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXK1P85037 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXK1P85037 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXK1P85037 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXK1P85037 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms