Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPCAP84074 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPCAP84074 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
HPCAP84074 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPCAP84074 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPCAP84074 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPCAP84074 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPCAP84074 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPCAP84074 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPCAP84074 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPCAP84074 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPCAP84074 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPCAP84074 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPCAP84074 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPCAP84074 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPCAP84074 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPCAP84074 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPCAP84074 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPCAP84074 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPCAP84074 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPCAP84074 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPCAP84074 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPCAP84074 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPCAP84074 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPCAP84074 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPCAP84074 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPCAP84074 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPCAP84074 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPCAP84074 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HPCAP84074 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPCAP84074 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPCAP84074 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPCAP84074 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPCAP84074 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPCAP84074 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPCAP84074 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HPCAP84074 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPCAP84074 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPCAP84074 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPCAP84074 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPCAP84074 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPCAP84074 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPCAP84074 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPCAP84074 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPCAP84074 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPCAP84074 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPCAP84074 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPCAP84074 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPCAP84074 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPCAP84074 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPCAP84074 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPCAP84074 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPCAP84074 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPCAP84074 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPCAP84074 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPCAP84074 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HPCAP84074 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPCAP84074 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPCAP84074 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPCAP84074 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPCAP84074 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPCAP84074 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HPCAP84074 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HPCAP84074 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HPCAP84074 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HPCAP84074 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPCAP84074 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HPCAP84074 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPCAP84074 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPCAP84074 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPCAP84074 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPCAP84074 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPCAP84074 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPCAP84074 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPCAP84074 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPCAP84074 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPCAP84074 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPCAP84074 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPCAP84074 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPCAP84074 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPCAP84074 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPCAP84074 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPCAP84074 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPCAP84074 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPCAP84074 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPCAP84074 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPCAP84074 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPCAP84074 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPCAP84074 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HPCAP84074 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPCAP84074 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPCAP84074 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPCAP84074 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPCAP84074 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPCAP84074 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HPCAP84074 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPCAP84074 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPCAP84074 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPCAP84074 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPCAP84074 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms