Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUCB2P80303 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUCB2P80303 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUCB2P80303 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms