Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC5P78333 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC5P78333 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC5P78333 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC5P78333 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC5P78333 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPC5P78333 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC5P78333 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC5P78333 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC5P78333 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC5P78333 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC5P78333 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC5P78333 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC5P78333 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPC5P78333 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC5P78333 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC5P78333 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC5P78333 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC5P78333 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC5P78333 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC5P78333 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC5P78333 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPC5P78333 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPC5P78333 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPC5P78333 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPC5P78333 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPC5P78333 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPC5P78333 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPC5P78333 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPC5P78333 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPC5P78333 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPC5P78333 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPC5P78333 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC5P78333 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC5P78333 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC5P78333 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC5P78333 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC5P78333 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC5P78333 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC5P78333 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC5P78333 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC5P78333 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPC5P78333 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC5P78333 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC5P78333 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC5P78333 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC5P78333 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC5P78333 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC5P78333 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC5P78333 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC5P78333 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC5P78333 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC5P78333 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC5P78333 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC5P78333 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC5P78333 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC5P78333 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC5P78333 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC5P78333 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC5P78333 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC5P78333 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC5P78333 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC5P78333 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC5P78333 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC5P78333 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC5P78333 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC5P78333 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC5P78333 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC5P78333 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC5P78333 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC5P78333 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC5P78333 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC5P78333 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC5P78333 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC5P78333 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC5P78333 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC5P78333 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC5P78333 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC5P78333 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC5P78333 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC5P78333 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC5P78333 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC5P78333 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC5P78333 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC5P78333 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC5P78333 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC5P78333 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC5P78333 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC5P78333 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC5P78333 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC5P78333 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC5P78333 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC5P78333 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC5P78333 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC5P78333 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC5P78333 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC5P78333 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC5P78333 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC5P78333 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC5P78333 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
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