Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL23AP62750 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL23AP62750 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms