Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK11-1P61568 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms