Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNAP25P60880 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms