Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVPABLB-1P60509 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ERVPABLB-1P60509 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVPABLB-1P60509 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms