Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCBP4P57723 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCBP4P57723 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCBP4P57723 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms