Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2KP53803 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 446.8 ms