Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2D1P51668 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D1P51668 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms