Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNA2P51530 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNA2P51530 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNA2P51530 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNA2P51530 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DNA2P51530 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNA2P51530 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNA2P51530 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNA2P51530 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNA2P51530 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNA2P51530 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNA2P51530 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DNA2P51530 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNA2P51530 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNA2P51530 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNA2P51530 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNA2P51530 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNA2P51530 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNA2P51530 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNA2P51530 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNA2P51530 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNA2P51530 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNA2P51530 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNA2P51530 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNA2P51530 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNA2P51530 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNA2P51530 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNA2P51530 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNA2P51530 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNA2P51530 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNA2P51530 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNA2P51530 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNA2P51530 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNA2P51530 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNA2P51530 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNA2P51530 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNA2P51530 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNA2P51530 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNA2P51530 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNA2P51530 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNA2P51530 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNA2P51530 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNA2P51530 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNA2P51530 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNA2P51530 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNA2P51530 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNA2P51530 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNA2P51530 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNA2P51530 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNA2P51530 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNA2P51530 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNA2P51530 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNA2P51530 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNA2P51530 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNA2P51530 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNA2P51530 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DNA2P51530 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNA2P51530 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNA2P51530 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNA2P51530 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNA2P51530 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNA2P51530 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNA2P51530 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNA2P51530 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNA2P51530 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNA2P51530 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNA2P51530 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNA2P51530 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNA2P51530 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNA2P51530 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNA2P51530 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNA2P51530 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNA2P51530 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNA2P51530 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNA2P51530 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNA2P51530 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNA2P51530 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNA2P51530 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNA2P51530 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNA2P51530 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNA2P51530 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNA2P51530 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNA2P51530 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNA2P51530 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNA2P51530 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNA2P51530 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNA2P51530 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNA2P51530 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNA2P51530 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNA2P51530 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNA2P51530 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNA2P51530 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNA2P51530 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNA2P51530 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNA2P51530 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNA2P51530 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DNA2P51530 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
DNA2P51530 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNA2P51530 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNA2P51530 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms