Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IDH3AP50213 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms