Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSK3BP49841 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GSK3BP49841 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GSK3BP49841 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms