Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FNTBP49356 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNTBP49356 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNTBP49356 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNTBP49356 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNTBP49356 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNTBP49356 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNTBP49356 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNTBP49356 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNTBP49356 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNTBP49356 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNTBP49356 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNTBP49356 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTBP49356 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTBP49356 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTBP49356 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTBP49356 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTBP49356 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTBP49356 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTBP49356 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTBP49356 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTBP49356 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTBP49356 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNTBP49356 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNTBP49356 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNTBP49356 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNTBP49356 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNTBP49356 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNTBP49356 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNTBP49356 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNTBP49356 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNTBP49356 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNTBP49356 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FNTBP49356 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNTBP49356 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNTBP49356 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNTBP49356 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNTBP49356 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNTBP49356 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNTBP49356 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNTBP49356 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNTBP49356 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNTBP49356 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNTBP49356 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNTBP49356 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNTBP49356 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNTBP49356 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNTBP49356 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNTBP49356 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNTBP49356 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNTBP49356 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNTBP49356 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNTBP49356 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FNTBP49356 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FNTBP49356 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
FNTBP49356 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNTBP49356 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNTBP49356 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNTBP49356 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNTBP49356 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNTBP49356 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNTBP49356 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNTBP49356 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTBP49356 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTBP49356 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTBP49356 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTBP49356 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTBP49356 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTBP49356 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTBP49356 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTBP49356 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTBP49356 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTBP49356 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTBP49356 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTBP49356 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTBP49356 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTBP49356 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTBP49356 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTBP49356 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNTBP49356 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNTBP49356 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNTBP49356 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNTBP49356 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNTBP49356 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNTBP49356 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNTBP49356 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNTBP49356 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNTBP49356 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNTBP49356 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNTBP49356 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FNTBP49356 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNTBP49356 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FNTBP49356 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNTBP49356 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNTBP49356 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNTBP49356 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNTBP49356 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNTBP49356 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FNTBP49356 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNTBP49356 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms