Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNTAP49354 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNTAP49354 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNTAP49354 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FNTAP49354 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNTAP49354 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNTAP49354 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNTAP49354 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNTAP49354 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNTAP49354 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNTAP49354 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNTAP49354 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNTAP49354 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNTAP49354 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FNTAP49354 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNTAP49354 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNTAP49354 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FNTAP49354 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNTAP49354 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNTAP49354 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNTAP49354 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNTAP49354 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNTAP49354 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNTAP49354 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNTAP49354 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FNTAP49354 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNTAP49354 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNTAP49354 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNTAP49354 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNTAP49354 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FNTAP49354 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FNTAP49354 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNTAP49354 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNTAP49354 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNTAP49354 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNTAP49354 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNTAP49354 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNTAP49354 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNTAP49354 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNTAP49354 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FNTAP49354 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FNTAP49354 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FNTAP49354 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FNTAP49354 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FNTAP49354 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FNTAP49354 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FNTAP49354 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FNTAP49354 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FNTAP49354 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FNTAP49354 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
FNTAP49354 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FNTAP49354 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FNTAP49354 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FNTAP49354 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FNTAP49354 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FNTAP49354 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FNTAP49354 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FNTAP49354 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FNTAP49354 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FNTAP49354 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FNTAP49354 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FNTAP49354 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FNTAP49354 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FNTAP49354 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNTAP49354 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNTAP49354 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNTAP49354 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNTAP49354 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNTAP49354 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNTAP49354 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNTAP49354 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FNTAP49354 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNTAP49354 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNTAP49354 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNTAP49354 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNTAP49354 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FNTAP49354 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FNTAP49354 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FNTAP49354 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FNTAP49354 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FNTAP49354 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FNTAP49354 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FNTAP49354 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FNTAP49354 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FNTAP49354 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FNTAP49354 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FNTAP49354 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FNTAP49354 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FNTAP49354 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FNTAP49354 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FNTAP49354 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FNTAP49354 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNTAP49354 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNTAP49354 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNTAP49354 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNTAP49354 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNTAP49354 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNTAP49354 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNTAP49354 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FNTAP49354 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms