Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSSP48449 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSSP48449 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSSP48449 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSSP48449 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSSP48449 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSSP48449 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSSP48449 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSSP48449 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSSP48449 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSSP48449 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSSP48449 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSSP48449 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSSP48449 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSSP48449 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSSP48449 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSSP48449 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LSSP48449 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSSP48449 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSSP48449 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSSP48449 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSSP48449 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSSP48449 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSSP48449 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSSP48449 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSSP48449 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSSP48449 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LSSP48449 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LSSP48449 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LSSP48449 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LSSP48449 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSSP48449 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LSSP48449 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSSP48449 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSSP48449 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSSP48449 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSSP48449 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSSP48449 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSSP48449 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSSP48449 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSSP48449 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSSP48449 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSSP48449 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSSP48449 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSSP48449 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSSP48449 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSSP48449 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSSP48449 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSSP48449 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSSP48449 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSSP48449 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSSP48449 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSSP48449 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LSSP48449 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LSSP48449 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LSSP48449 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LSSP48449 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSSP48449 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSSP48449 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSSP48449 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSSP48449 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LSSP48449 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSSP48449 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSSP48449 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSSP48449 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSSP48449 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSSP48449 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSSP48449 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSSP48449 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSSP48449 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSSP48449 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSSP48449 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSSP48449 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSSP48449 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSSP48449 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSSP48449 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSSP48449 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSSP48449 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSSP48449 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LSSP48449 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LSSP48449 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LSSP48449 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSSP48449 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LSSP48449 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSSP48449 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSSP48449 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSSP48449 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSSP48449 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSSP48449 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSSP48449 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSSP48449 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSSP48449 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSSP48449 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSSP48449 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSSP48449 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSSP48449 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSSP48449 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSSP48449 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LSSP48449 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSSP48449 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms