Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA4P43681 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNA4P43681 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA4P43681 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms