Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDFT1P37268 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms