Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACVR1BP36896 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACVR1BP36896 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 263.7 ms