Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ECHS1P30084 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECHS1P30084 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECHS1P30084 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms