Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE4AP27815 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE4AP27815 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE4AP27815 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
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