Protein–RNA interactions for Protein: P26373

RPL13, 60S ribosomal protein L13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13P26373 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL13P26373 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL13P26373 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL13P26373 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL13P26373 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL13P26373 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL13P26373 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL13P26373 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL13P26373 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL13P26373 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL13P26373 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL13P26373 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL13P26373 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL13P26373 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL13P26373 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL13P26373 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL13P26373 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL13P26373 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL13P26373 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL13P26373 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL13P26373 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL13P26373 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL13P26373 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL13P26373 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL13P26373 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL13P26373 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL13P26373 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL13P26373 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL13P26373 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL13P26373 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL13P26373 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL13P26373 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL13P26373 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL13P26373 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL13P26373 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL13P26373 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL13P26373 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL13P26373 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL13P26373 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL13P26373 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL13P26373 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPL13P26373 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPL13P26373 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPL13P26373 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPL13P26373 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPL13P26373 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPL13P26373 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPL13P26373 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL13P26373 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL13P26373 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL13P26373 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL13P26373 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL13P26373 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL13P26373 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL13P26373 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL13P26373 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL13P26373 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL13P26373 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL13P26373 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL13P26373 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL13P26373 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL13P26373 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL13P26373 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL13P26373 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL13P26373 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL13P26373 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL13P26373 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL13P26373 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL13P26373 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL13P26373 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL13P26373 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL13P26373 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL13P26373 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL13P26373 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL13P26373 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL13P26373 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL13P26373 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL13P26373 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL13P26373 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL13P26373 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL13P26373 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL13P26373 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL13P26373 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL13P26373 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL13P26373 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL13P26373 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL13P26373 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL13P26373 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPL13P26373 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPL13P26373 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPL13P26373 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPL13P26373 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPL13P26373 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL13P26373 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL13P26373 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL13P26373 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL13P26373 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL13P26373 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL13P26373 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL13P26373 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms