Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD247P20963 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD247P20963 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD247P20963 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD247P20963 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD247P20963 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD247P20963 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD247P20963 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD247P20963 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD247P20963 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD247P20963 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD247P20963 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD247P20963 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD247P20963 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD247P20963 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD247P20963 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD247P20963 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD247P20963 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD247P20963 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD247P20963 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD247P20963 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD247P20963 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD247P20963 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD247P20963 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD247P20963 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD247P20963 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD247P20963 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD247P20963 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD247P20963 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD247P20963 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CD247P20963 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD247P20963 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD247P20963 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD247P20963 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD247P20963 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD247P20963 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD247P20963 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD247P20963 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD247P20963 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD247P20963 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD247P20963 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD247P20963 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD247P20963 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CD247P20963 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD247P20963 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD247P20963 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD247P20963 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD247P20963 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD247P20963 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD247P20963 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD247P20963 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD247P20963 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD247P20963 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD247P20963 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD247P20963 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD247P20963 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD247P20963 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD247P20963 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD247P20963 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD247P20963 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD247P20963 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD247P20963 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD247P20963 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD247P20963 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD247P20963 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD247P20963 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD247P20963 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD247P20963 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD247P20963 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD247P20963 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD247P20963 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD247P20963 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD247P20963 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD247P20963 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD247P20963 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CD247P20963 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD247P20963 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD247P20963 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD247P20963 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD247P20963 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD247P20963 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD247P20963 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CD247P20963 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD247P20963 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD247P20963 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD247P20963 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD247P20963 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD247P20963 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD247P20963 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD247P20963 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD247P20963 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD247P20963 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD247P20963 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD247P20963 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD247P20963 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD247P20963 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD247P20963 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD247P20963 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD247P20963 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CD247P20963 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms