Protein–RNA interactions for Protein: P20336

RAB3A, Ras-related protein Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3AP20336 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB3AP20336 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RAB3AP20336 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms