Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFKB1P19838 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFKB1P19838 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKB1P19838 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms