Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XRCC1P18887 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XRCC1P18887 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms