Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLS3P13797 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLS3P13797 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLS3P13797 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLS3P13797 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLS3P13797 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLS3P13797 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLS3P13797 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLS3P13797 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLS3P13797 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLS3P13797 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLS3P13797 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLS3P13797 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLS3P13797 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLS3P13797 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLS3P13797 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLS3P13797 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLS3P13797 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLS3P13797 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLS3P13797 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLS3P13797 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLS3P13797 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLS3P13797 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLS3P13797 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLS3P13797 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLS3P13797 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLS3P13797 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLS3P13797 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLS3P13797 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLS3P13797 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLS3P13797 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLS3P13797 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLS3P13797 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLS3P13797 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLS3P13797 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLS3P13797 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLS3P13797 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PLS3P13797 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLS3P13797 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PLS3P13797 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PLS3P13797 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLS3P13797 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PLS3P13797 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLS3P13797 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLS3P13797 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLS3P13797 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLS3P13797 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLS3P13797 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLS3P13797 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLS3P13797 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLS3P13797 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLS3P13797 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLS3P13797 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLS3P13797 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLS3P13797 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLS3P13797 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLS3P13797 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLS3P13797 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLS3P13797 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLS3P13797 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLS3P13797 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PLS3P13797 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLS3P13797 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLS3P13797 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLS3P13797 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLS3P13797 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLS3P13797 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLS3P13797 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLS3P13797 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLS3P13797 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLS3P13797 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLS3P13797 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLS3P13797 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLS3P13797 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLS3P13797 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLS3P13797 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLS3P13797 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PLS3P13797 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLS3P13797 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PLS3P13797 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PLS3P13797 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLS3P13797 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PLS3P13797 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLS3P13797 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLS3P13797 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLS3P13797 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLS3P13797 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLS3P13797 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLS3P13797 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLS3P13797 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLS3P13797 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLS3P13797 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PLS3P13797 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLS3P13797 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLS3P13797 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLS3P13797 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLS3P13797 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLS3P13797 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLS3P13797 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLS3P13797 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms