Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLA-DOBP13765 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-DOBP13765 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-DOBP13765 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-DOBP13765 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-DOBP13765 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-DOBP13765 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-DOBP13765 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-DOBP13765 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-DOBP13765 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-DOBP13765 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-DOBP13765 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-DOBP13765 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-DOBP13765 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-DOBP13765 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-DOBP13765 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-DOBP13765 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-DOBP13765 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-DOBP13765 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-DOBP13765 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-DOBP13765 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-DOBP13765 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DOBP13765 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DOBP13765 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms