Protein–RNA interactions for Protein: P13611

VCAN, Versican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCANP13611 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCANP13611 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCANP13611 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VCANP13611 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCANP13611 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VCANP13611 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCANP13611 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCANP13611 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCANP13611 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VCANP13611 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VCANP13611 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCANP13611 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VCANP13611 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCANP13611 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCANP13611 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCANP13611 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCANP13611 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCANP13611 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCANP13611 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCANP13611 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCANP13611 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCANP13611 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCANP13611 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCANP13611 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
VCANP13611 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VCANP13611 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCANP13611 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VCANP13611 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCANP13611 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCANP13611 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCANP13611 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCANP13611 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCANP13611 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCANP13611 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCANP13611 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCANP13611 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCANP13611 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCANP13611 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCANP13611 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCANP13611 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCANP13611 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCANP13611 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCANP13611 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCANP13611 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCANP13611 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCANP13611 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VCANP13611 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VCANP13611 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VCANP13611 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VCANP13611 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VCANP13611 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VCANP13611 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VCANP13611 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VCANP13611 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCANP13611 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCANP13611 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCANP13611 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCANP13611 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCANP13611 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCANP13611 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCANP13611 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCANP13611 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCANP13611 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCANP13611 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCANP13611 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCANP13611 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCANP13611 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCANP13611 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCANP13611 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCANP13611 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCANP13611 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VCANP13611 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VCANP13611 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VCANP13611 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VCANP13611 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VCANP13611 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VCANP13611 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VCANP13611 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VCANP13611 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCANP13611 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCANP13611 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCANP13611 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCANP13611 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCANP13611 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCANP13611 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCANP13611 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCANP13611 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCANP13611 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCANP13611 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCANP13611 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VCANP13611 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCANP13611 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCANP13611 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCANP13611 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCANP13611 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VCANP13611 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCANP13611 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCANP13611 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCANP13611 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VCANP13611 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137 ms