Protein–RNA interactions for Protein: P12956

XRCC6, X-ray repair cross-complementing protein 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC6P12956 TMEM14B-207ENST00000467229 483 ntTSL 37□□□□□ -1.291e-7■■■□□ 17.8
XRCC6P12956 TMEM14B-217ENST00000489137 374 ntTSL 34.58□□□□□ -1.681e-7■■■□□ 17.8
XRCC6P12956 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.491e-6■■■□□ 17.8
XRCC6P12956 SYCP2L-202ENST00000341041 3069 ntTSL 214.25□□□□□ -0.131e-6■■■□□ 17.8
XRCC6P12956 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.922e-8■■■□□ 17.8
XRCC6P12956 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.722e-8■■■□□ 17.8
XRCC6P12956 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.672e-8■■■□□ 17.8
XRCC6P12956 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.212e-8■■■□□ 17.8
XRCC6P12956 SCP2-210ENST00000478631 5204 ntTSL 213.94□□□□□ -0.182e-8■■■□□ 17.8
XRCC6P12956 SCP2-209ENST00000478274 969 ntTSL 212.26□□□□□ -0.452e-8■■■□□ 17.8
XRCC6P12956 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.112e-8■■■□□ 17.8
XRCC6P12956 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.212e-8■■■□□ 17.8
XRCC6P12956 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.282e-8■■■□□ 17.8
XRCC6P12956 SCP2-216ENST00000533119 742 ntTSL 55.52□□□□□ -1.532e-8■■■□□ 17.8
XRCC6P12956 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.622e-8■■■□□ 17.8
XRCC6P12956 SCP2-211ENST00000484100 671 ntTSL 24.55□□□□□ -1.682e-8■■■□□ 17.8
XRCC6P12956 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.929e-11■■■□□ 17.7
XRCC6P12956 DNAJB6-208ENST00000441561 1022 ntTSL 517.94■□□□□ 0.469e-11■■■□□ 17.7
XRCC6P12956 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.469e-11■■■□□ 17.7
XRCC6P12956 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.449e-11■■■□□ 17.7
XRCC6P12956 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.049e-11■■■□□ 17.7
XRCC6P12956 DNAJB6-211ENST00000459889 7992 ntTSL 1 (best)15.16■□□□□ 0.029e-11■■■□□ 17.7
XRCC6P12956 DNAJB6-214ENST00000486083 699 ntTSL 514.42□□□□□ -0.19e-11■■■□□ 17.7
XRCC6P12956 DNAJB6-210ENST00000453383 590 ntTSL 413.15□□□□□ -0.39e-11■■■□□ 17.7
XRCC6P12956 DNAJB6-207ENST00000441291 614 ntTSL 312.7□□□□□ -0.389e-11■■■□□ 17.7
XRCC6P12956 DNAJB6-203ENST00000417758 852 ntTSL 512.47□□□□□ -0.419e-11■■■□□ 17.7
XRCC6P12956 DNAJB6-202ENST00000412557 506 ntTSL 312.45□□□□□ -0.429e-11■■■□□ 17.7
XRCC6P12956 DNAJB6-205ENST00000437030 566 ntTSL 512.38□□□□□ -0.439e-11■■■□□ 17.7
XRCC6P12956 DNAJB6-217ENST00000488001 551 ntTSL 410.03□□□□□ -0.89e-11■■■□□ 17.7
XRCC6P12956 ARL8B-203ENST00000429403 709 ntTSL 520.96■□□□□ 0.954e-7■■■□□ 17.7
XRCC6P12956 ARL8B-204ENST00000444332 732 ntTSL 220.67■□□□□ 0.94e-7■■■□□ 17.7
XRCC6P12956 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.784e-7■■■□□ 17.7
XRCC6P12956 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.774e-7■■■□□ 17.7
XRCC6P12956 ARL8B-205ENST00000455168 1641 ntTSL 219.54■□□□□ 0.724e-7■■■□□ 17.7
XRCC6P12956 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.14e-7■■■□□ 17.7
XRCC6P12956 TCERG1-202ENST00000394421 3633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.144e-7■■■□□ 17.7
XRCC6P12956 TCERG1-216ENST00000549332 3518 ntTSL 513.16□□□□□ -0.34e-7■■■□□ 17.7
XRCC6P12956 TCERG1-201ENST00000296702 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.334e-7■■■□□ 17.7
XRCC6P12956 TCERG1-206ENST00000506524 3787 ntTSL 1 (best)7.38□□□□□ -1.234e-7■■■□□ 17.7
XRCC6P12956 TCERG1-205ENST00000505285 486 ntTSL 26.33□□□□□ -1.44e-7■■■□□ 17.7
XRCC6P12956 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.051e-7■■■□□ 17.6
XRCC6P12956 RAC3-204ENST00000585014 798 ntTSL 220.87■□□□□ 0.931e-7■■■□□ 17.6
XRCC6P12956 IGFL2-AS1-204ENST00000598754 470 ntTSL 212.33□□□□□ -0.443e-6■■■□□ 17.6
XRCC6P12956 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.321e-9■■■□□ 17.6
XRCC6P12956 AP003900.1-202ENST00000616952 225 ntTSL 310.83□□□□□ -0.681e-9■■■□□ 17.6
XRCC6P12956 DDX6-202ENST00000526070 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.176e-14■■■□□ 17.6
XRCC6P12956 DDX6-201ENST00000525082 1232 ntTSL 211.28□□□□□ -0.66e-14■■■□□ 17.6
XRCC6P12956 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.986e-14■■■□□ 17.6
XRCC6P12956 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.246e-14■■■□□ 17.6
XRCC6P12956 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.836e-14■■■□□ 17.6
XRCC6P12956 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.149e-28■■■□□ 17.5
XRCC6P12956 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.331e-9■■■□□ 17.5
XRCC6P12956 PFKL-206ENST00000467315 1947 ntTSL 222.25■■□□□ 1.155e-7■■■□□ 17.5
XRCC6P12956 PFKL-204ENST00000460521 2818 ntTSL 217.89■□□□□ 0.455e-7■■■□□ 17.5
XRCC6P12956 RPSA-207ENST00000478027 1227 ntTSL 212.88□□□□□ -0.358e-8■■■□□ 17.5
XRCC6P12956 RPSA-204ENST00000458478 874 ntTSL 212.53□□□□□ -0.48e-8■■■□□ 17.5
XRCC6P12956 RPSA-201ENST00000301821 1171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.628e-8■■■□□ 17.5
XRCC6P12956 RPSA-209ENST00000495394 2058 ntTSL 1 (best)10.86□□□□□ -0.678e-8■■■□□ 17.5
XRCC6P12956 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.18e-8■■■□□ 17.5
XRCC6P12956 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.923e-7■■■□□ 17.4
XRCC6P12956 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.643e-7■■■□□ 17.4
XRCC6P12956 ABO-201ENST00000453660 6341 ntTSL 1 (best)14.65□□□□□ -0.063e-7■■■□□ 17.4
XRCC6P12956 PFKL-205ENST00000466134 5986 ntTSL 222.84■■□□□ 1.251e-6■■■□□ 17.4
XRCC6P12956 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.031e-6■■■□□ 17.4
XRCC6P12956 PFKL-202ENST00000397961 3390 ntTSL 1 (best)18.29■□□□□ 0.521e-6■■■□□ 17.4
XRCC6P12956 FASN-207ENST00000635197 627 ntTSL 317.7■□□□□ 0.427e-8■■■□□ 17.4
XRCC6P12956 CRKL-202ENST00000411769 2037 ntTSL 1 (best)23.18■■□□□ 1.39e-23■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.879e-23■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.518e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 TTLL3-210ENST00000427220 3233 ntTSL 1 (best)24.09■■□□□ 1.458e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.398e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.178e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.838e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.828e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.88e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.88e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 ZFPM1-202ENST00000562417 497 ntTSL 319.73■□□□□ 0.758e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 PSMA1-206ENST00000528018 479 ntTSL 219.58■□□□□ 0.728e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.538e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 PLCD1-203ENST00000461445 3271 ntTSL 218.18■□□□□ 0.58e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.468e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 PLCD1-202ENST00000417185 685 ntTSL 217.34■□□□□ 0.378e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.298e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.198e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 HOXB-AS1-202ENST00000502764 578 ntTSL 316.02■□□□□ 0.168e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 CTPS1-202ENST00000372621 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.148e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 FBXL5-205ENST00000507700 2306 ntTSL 1 (best)15.67■□□□□ 0.18e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.098e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 TTLL3-203ENST00000414814 549 ntTSL 515.04■□□□□ -08e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 TTLL3-212ENST00000430718 536 ntTSL 415.04■□□□□ -08e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 HOXB-AS1-204ENST00000508688 414 ntTSL 314.65□□□□□ -0.068e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 TTLL3-205ENST00000418745 540 ntTSL 414.52□□□□□ -0.098e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.188e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.198e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 FXYD5-206ENST00000496493 729 ntTSL 313.84□□□□□ -0.198e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 TTLL3-222ENST00000459758 555 ntTSL 413.73□□□□□ -0.218e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 TTLL3-204ENST00000417065 565 ntTSL 413.73□□□□□ -0.218e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 TTLL3-207ENST00000422738 545 ntTSL 413.73□□□□□ -0.218e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 FBXL5-209ENST00000511441 2951 ntTSL 1 (best)13.63□□□□□ -0.238e-6■■■□□ 17.3
XRCC6P12956 TTLL3-214ENST00000431204 1041 ntTSL 512.9□□□□□ -0.348e-6■■■□□ 17.3
Retrieved 100 of 6,788 protein–RNA pairs in 83 ms