Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK4P11802 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK4P11802 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK4P11802 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK4P11802 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK4P11802 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK4P11802 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK4P11802 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK4P11802 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK4P11802 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK4P11802 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK4P11802 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK4P11802 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK4P11802 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK4P11802 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK4P11802 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK4P11802 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK4P11802 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK4P11802 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK4P11802 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK4P11802 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK4P11802 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK4P11802 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK4P11802 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK4P11802 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK4P11802 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK4P11802 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK4P11802 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK4P11802 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK4P11802 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK4P11802 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK4P11802 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK4P11802 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK4P11802 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK4P11802 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK4P11802 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK4P11802 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK4P11802 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK4P11802 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK4P11802 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK4P11802 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK4P11802 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK4P11802 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK4P11802 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK4P11802 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK4P11802 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK4P11802 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK4P11802 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK4P11802 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK4P11802 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK4P11802 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK4P11802 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK4P11802 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK4P11802 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK4P11802 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK4P11802 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK4P11802 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK4P11802 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK4P11802 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK4P11802 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK4P11802 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK4P11802 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK4P11802 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK4P11802 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK4P11802 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK4P11802 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK4P11802 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK4P11802 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK4P11802 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK4P11802 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK4P11802 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK4P11802 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK4P11802 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK4P11802 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK4P11802 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK4P11802 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK4P11802 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK4P11802 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK4P11802 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK4P11802 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK4P11802 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK4P11802 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK4P11802 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK4P11802 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK4P11802 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK4P11802 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK4P11802 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK4P11802 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK4P11802 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK4P11802 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK4P11802 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK4P11802 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK4P11802 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK4P11802 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK4P11802 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK4P11802 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK4P11802 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK4P11802 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK4P11802 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK4P11802 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms