Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI1P08151 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI1P08151 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI1P08151 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI1P08151 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLI1P08151 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI1P08151 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI1P08151 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI1P08151 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI1P08151 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI1P08151 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI1P08151 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI1P08151 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI1P08151 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI1P08151 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI1P08151 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI1P08151 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI1P08151 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLI1P08151 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLI1P08151 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLI1P08151 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLI1P08151 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLI1P08151 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI1P08151 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI1P08151 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI1P08151 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI1P08151 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI1P08151 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI1P08151 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GLI1P08151 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI1P08151 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI1P08151 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI1P08151 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI1P08151 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI1P08151 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI1P08151 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI1P08151 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI1P08151 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLI1P08151 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI1P08151 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI1P08151 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI1P08151 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI1P08151 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI1P08151 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI1P08151 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI1P08151 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI1P08151 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI1P08151 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI1P08151 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI1P08151 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI1P08151 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI1P08151 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI1P08151 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI1P08151 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLI1P08151 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI1P08151 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI1P08151 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI1P08151 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI1P08151 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI1P08151 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI1P08151 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI1P08151 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI1P08151 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI1P08151 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI1P08151 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI1P08151 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI1P08151 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI1P08151 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI1P08151 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI1P08151 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI1P08151 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI1P08151 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI1P08151 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI1P08151 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI1P08151 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI1P08151 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI1P08151 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI1P08151 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI1P08151 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI1P08151 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI1P08151 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI1P08151 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLI1P08151 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLI1P08151 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLI1P08151 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLI1P08151 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLI1P08151 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLI1P08151 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI1P08151 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI1P08151 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI1P08151 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI1P08151 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI1P08151 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI1P08151 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI1P08151 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI1P08151 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI1P08151 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI1P08151 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI1P08151 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI1P08151 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms