Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALCAP01258 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALCAP01258 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALCAP01258 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALCAP01258 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALCAP01258 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALCAP01258 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALCAP01258 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALCAP01258 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALCAP01258 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALCAP01258 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALCAP01258 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALCAP01258 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALCAP01258 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALCAP01258 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALCAP01258 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALCAP01258 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALCAP01258 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALCAP01258 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALCAP01258 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALCAP01258 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALCAP01258 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALCAP01258 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALCAP01258 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCAP01258 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCAP01258 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCAP01258 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCAP01258 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCAP01258 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCAP01258 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCAP01258 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCAP01258 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCAP01258 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCAP01258 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCAP01258 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCAP01258 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALCAP01258 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCAP01258 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCAP01258 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCAP01258 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCAP01258 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCAP01258 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCAP01258 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCAP01258 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALCAP01258 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCAP01258 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCAP01258 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCAP01258 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCAP01258 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCAP01258 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCAP01258 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCAP01258 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCAP01258 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCAP01258 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCAP01258 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCAP01258 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCAP01258 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALCAP01258 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALCAP01258 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALCAP01258 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALCAP01258 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALCAP01258 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALCAP01258 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALCAP01258 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALCAP01258 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALCAP01258 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCAP01258 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCAP01258 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCAP01258 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCAP01258 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCAP01258 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCAP01258 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCAP01258 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCAP01258 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCAP01258 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCAP01258 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCAP01258 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCAP01258 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCAP01258 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCAP01258 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALCAP01258 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALCAP01258 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALCAP01258 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALCAP01258 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CALCAP01258 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALCAP01258 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALCAP01258 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALCAP01258 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALCAP01258 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALCAP01258 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALCAP01258 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALCAP01258 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALCAP01258 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALCAP01258 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALCAP01258 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALCAP01258 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALCAP01258 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALCAP01258 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALCAP01258 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALCAP01258 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms