Protein–RNA interactions for Protein: P01137

TGFB1, Transforming growth factor beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB1P01137 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGFB1P01137 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGFB1P01137 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGFB1P01137 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGFB1P01137 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGFB1P01137 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGFB1P01137 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TGFB1P01137 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGFB1P01137 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGFB1P01137 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGFB1P01137 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGFB1P01137 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGFB1P01137 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGFB1P01137 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGFB1P01137 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGFB1P01137 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGFB1P01137 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGFB1P01137 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGFB1P01137 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TGFB1P01137 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGFB1P01137 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGFB1P01137 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGFB1P01137 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGFB1P01137 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGFB1P01137 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGFB1P01137 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGFB1P01137 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGFB1P01137 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGFB1P01137 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGFB1P01137 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGFB1P01137 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGFB1P01137 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGFB1P01137 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TGFB1P01137 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFB1P01137 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFB1P01137 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFB1P01137 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFB1P01137 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFB1P01137 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFB1P01137 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFB1P01137 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TGFB1P01137 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms