Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG12O94817 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG12O94817 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG12O94817 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG12O94817 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG12O94817 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG12O94817 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG12O94817 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG12O94817 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG12O94817 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG12O94817 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG12O94817 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG12O94817 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG12O94817 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG12O94817 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG12O94817 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG12O94817 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG12O94817 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG12O94817 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG12O94817 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG12O94817 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG12O94817 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG12O94817 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG12O94817 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG12O94817 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG12O94817 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG12O94817 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG12O94817 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG12O94817 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG12O94817 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG12O94817 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG12O94817 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG12O94817 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG12O94817 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG12O94817 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG12O94817 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG12O94817 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG12O94817 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG12O94817 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG12O94817 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG12O94817 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG12O94817 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG12O94817 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG12O94817 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG12O94817 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG12O94817 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG12O94817 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG12O94817 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG12O94817 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG12O94817 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG12O94817 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG12O94817 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG12O94817 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG12O94817 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG12O94817 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG12O94817 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG12O94817 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG12O94817 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG12O94817 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG12O94817 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG12O94817 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG12O94817 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG12O94817 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG12O94817 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG12O94817 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG12O94817 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG12O94817 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG12O94817 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG12O94817 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG12O94817 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG12O94817 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG12O94817 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG12O94817 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG12O94817 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG12O94817 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG12O94817 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG12O94817 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG12O94817 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG12O94817 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG12O94817 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG12O94817 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG12O94817 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG12O94817 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG12O94817 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG12O94817 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG12O94817 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG12O94817 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG12O94817 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG12O94817 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG12O94817 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG12O94817 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG12O94817 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG12O94817 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG12O94817 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG12O94817 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG12O94817 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG12O94817 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG12O94817 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG12O94817 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG12O94817 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms