Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH16O75309 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH16O75309 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH16O75309 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH16O75309 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH16O75309 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH16O75309 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH16O75309 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH16O75309 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH16O75309 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH16O75309 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH16O75309 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH16O75309 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH16O75309 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH16O75309 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH16O75309 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH16O75309 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH16O75309 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH16O75309 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH16O75309 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH16O75309 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH16O75309 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH16O75309 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH16O75309 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH16O75309 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH16O75309 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH16O75309 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH16O75309 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH16O75309 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH16O75309 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH16O75309 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH16O75309 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH16O75309 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH16O75309 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH16O75309 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH16O75309 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH16O75309 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH16O75309 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH16O75309 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH16O75309 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH16O75309 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH16O75309 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH16O75309 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH16O75309 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH16O75309 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH16O75309 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH16O75309 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH16O75309 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH16O75309 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH16O75309 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH16O75309 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH16O75309 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH16O75309 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH16O75309 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH16O75309 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH16O75309 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH16O75309 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH16O75309 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH16O75309 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH16O75309 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH16O75309 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH16O75309 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH16O75309 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH16O75309 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH16O75309 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH16O75309 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH16O75309 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH16O75309 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH16O75309 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH16O75309 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH16O75309 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH16O75309 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH16O75309 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH16O75309 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH16O75309 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH16O75309 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH16O75309 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH16O75309 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH16O75309 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH16O75309 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH16O75309 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH16O75309 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH16O75309 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH16O75309 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH16O75309 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH16O75309 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH16O75309 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH16O75309 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH16O75309 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH16O75309 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH16O75309 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH16O75309 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH16O75309 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH16O75309 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH16O75309 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH16O75309 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH16O75309 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH16O75309 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH16O75309 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH16O75309 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms