Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT3O75175 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT3O75175 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms